Sozinova O. Analysis of puroindolines in common wheat and related species of grasses

Українська версія

Thesis for the degree of Doctor of Philosophy (PhD)

State registration number

0826U004500

Applicant for

Specialization

  • 091 - Біологія

01-10-2026

Specialized Academic Board

PhD 16859

Institute of Food Biotechnology and Genomics of the National Academy of Sciences of Ukraine

Essay

The thesis is devoted to the study of puroindoline genes in common wheat and related species of grasses. In the framework of the study, sequences of the Pina and Pinb genes of the extra soft Triticum aestivum L. varieties Biliava and Oksana, the Pina gene of the Ukrainian T. boeoticum var. baydaricum UA0300333 accession, as well as the Sina and Sinb genes of the wild rye S. sylvestre, were determined, and the analysis of frequencies of substitutions relative to the reference sequences of the common wheat variety Chinese Spring (CS) was made for the Pina and Pinb genes of diploid wheat species, diploid Aegilops species and Sina and Sinb of S. cereale. Primers for producing amplicons of common wheat, T. monococcum, and Aegilops biuncialis puroindoline genes, as well as S. sylvestre secalindoline genes, were selected.The identification of unique amino acid substitutions in S. sylvestre puroindoline a indicates its potential for obtaining new variants of antimicrobial proteins. The study of polymorphisms in the diploid Aegilops species and the identification of the Pinb amplicon length polymorphism in Ae. biuncialis will provide new markers for investigating genetic diversity of Ae. biuncialis populations. Markers for the T. monococcum-type alleles developed on the basis of the polymorphisms will enable marker-assisted selection of extra soft genotypes and improve the efficiency of breeding extra soft varieties, the flour from which is intended for making products of strategic importance, namely biscuits, breakfast cereals, etc. The results of the study will contribute to attaining sustainable development goal 2: Zero Hunger – promoting sustainable agriculture, ensuring food security, and improving nutrition.

Research papers

Созінова, О.І., & Блюм, Я.Б. (2025). Однонуклеотидні поліморфізми в послідовностях гена Pina деяких диплоїдних видів роду Aegilops. Наукові записки НаУКМА. Біологія і екологія, 8, 55–61. https://doi.org/10.18523/2617–4529.2025.8.55–61 (Особистий внесок здобувача: участь у проведенні дослідження, обробка результатів, написання статті).

Созінова, О.І., & Блюм, Я.Б. (2024). Аналіз однонуклеотидних поліморфізмів у послідовностях генів Pina та Pinb диплоїдних пшениць Triticum monococcum і T. urartu. Наукові записки НаУКМА. Біологія і екологія, 7, 27–35. https://doi.org/10.18523/2617–4529.2024.7.27–35 (Особистий внесок здобувача: участь у проведенні дослідження, обробка результатів, написання статті).

Sozinova, O.I., Kozub, N.O., & Blume, Ya.B. (2023). Polymorphism of Pinb–1 gene length in Aegilops biuncialis Vis. Cytology and Genetics, 57(4), 298–304. https://doi.org/10.3103/S0095452723040102 (Scopus Q4). (Особистий внесок здобувача: участь у проведенні експериментальних досліджень, обробка результатів, написання статті).

Созінова O.I., Козуб Н.О., Созінов І.О., & Блюм Я.Б. (2018). Геномна специфічність праймерів до пуроіндолінових генів. Фактори експериментальної еволюції організмів, 22, 191–195. https://doi.org/10.7124/FEEO.v22.947 (Особистий внесок здобувача: участь у проведенні експериментальних досліджень, обробка результатів, написання статті).

1. Sozinova, O.I., Kozub, N.O., Karelov, A.V., Sozinov, I.O., & Blume, Y.B. (2026). Wheat prolamin superfamily as a challenging target for genome editing. In: K.A. Abd–Elsalam, & A. Ahmad (Eds.), Gene Editing in Cereals. Sustainability Sciences in Asia and Africa (pp. 207–223). Springer, Singapore. https://doi.org/10.1007/978–981–95–6722–5_8 (Особистий внесок здобувача: аналіз літературних джерел, участь у написанні розділу монографії).

Созінова, О.І., & Блюм, Я.Б. (2026а). Застосування молекулярних маркерів для добору генотипів пшениці з ознакою екстрам’якозерності. Матеріали VI конференції молодих учених «Біологія рослин та біотехнологія» (с. 26). Київ.

Созінова, О.І., & Блюм, Я.Б. (2026b). Ідентифікація SNP пуроіндоліну b в деяких диплоїдних представниках роду Aegilops. Матеріали VI конференції молодих учених «Біологія рослин та біотехнологія» (с. 27). Київ.

Созінова, О.І., Козуб, Н.О., Созінов, І.О., & Блюм Я.Б. (2026c). Розробка молекулярних маркерів для добору екстрам’якозерних генотипів пшениці. Матеріали VІ міжнародної науково–практичної конференції «Проблеми та досягнення сучасної біотехнології». (с. 369– 371). Харків.

Sozinova, O., Kozub, N., Sozinov, I., & Blume, Y. (2025a). Analysis of the secaloindoline a gene of the wild rye species Secale sylvestre. In Scientific international symposium «Advanced biotechnologies – achievements and prospects» (VIIth Edition). (pp. 292–293). Chisinau. https://doi.org/10.53040/abap7.2025

Созінова, О.І., & Блюм, Я.Б. (2025b) Аналіз однонуклеотидного поліморфізму гена пуроіндоліну а диплоїдних пшениць. Матеріали V конференції молодих вчених «Біологія рослин та біотехнологія». (с. 21). Київ.

Sozinova, O., & Blume, Y. (2024a). Analysis of the Pina gene of the Triticum boeoticum var. baydaricum accession. In The National conference 11 with international participation, edition VII «Natural sciences in the dialogue of generations». (p. 111). Chisinau.

Sozinova, O., Kozub, N., Sozinov, I., & Blume, Y. (2024b). Sequence of the puroindoline a gene in the Ukrainian wild diploid wheat accession. In 6th International scientific conference «Agrobiodiversity for Improving the Nutrition, Health, Quality of People Life and Nature». (p. 126). Nitra. https://doi.org/10.15414/2024.9788055227702

Созінова, О.І., & Блюм, Я.Б. (2024c). Аналіз послідовності гена пуроіндоліну а екстрам’якозерного сорту пшениці м’якої ‘Оксана’. Матеріали IV конференції молодих вчених «Біологія рослин та біотехнологія». (с. 23). Київ.

Созінова, О.І., Козуб, Н.О., Созінов, І.О., & Блюм Я.Б. (2022). Дослідження поліморфізму пуроіндолінових генів Aegilops biuncialis Vis. за довжиною ампліконів. Матеріали VII Всеукраїнської науково– практичної конференції «Генетика і селекція в сучасному агрокомплексі». (с. 148–150). Умань.

Files

Similar theses