Stroi Y. Pathogenetic significance of long non-coding RNA gene polymorphism in the development of urinary system сancers

Українська версія

Thesis for the degree of Doctor of Philosophy (PhD)

State registration number

0826U004662

Thesis Registration Form

0826U004662.pdf

Applicant for

Specialization

  • 222 - Медицина

03-09-2026

Specialized Academic Board

PhD 15569

Sumy State University

Essay

The dissertation work is devoted to elucidating the role of lncRNA gene polymorphisms ANRIL (rs1333049), MALAT1 (rs619586), and HOTAIR (rs4759314) in the pathogenesis of malignant neoplastic diseases of the urinary system. The prospective cohort case-control study involved 342 representatives of the Ukrainian population of the North-Eastern region: the main group consisted of 242 individuals with oncological diseases of the urinary system (101 with clear cell renal cell carcinoma [ccRCC] and 141 with urothelial carcinoma of the bladder [UCB], clinical stage I–II according to TNM) and the control group consisted of 100 individuals without an oncological history. DNA genotyping from venous blood was performed using Real-Time PCR with TaqMan assays on a QuantStudio 5 DX instrument. For the first time, allele and genotype frequencies for the studied loci were determined in the control group: 0.48 for rs1333049, 0.02 for rs619586, and 0.05 for rs4759314, corresponding to European population indices. A statistically significant difference in genotype distribution between oncourological patients and controls was found only for the MALAT1 gene rs619586 polymorphism (P = 0.039). Carrying the minor G-allele of MALAT1 (A/G and G/G genotypes) was associated with a 3.43-fold higher probability of developing urinary tract malignancies compared to A/A homozygotes (P = 0.037, OR = 3.43; 95% CI: 1.07–10.97). The ANRIL gene rs1333049 locus was identified as an independent predictor of ccRCC development, with the minor C-allele associated with a 3.1-fold increase in risk (P = 0.040, OR = 3.10; 95% CI: 1.05–9.18). The HOTAIR gene rs4759314 polymorphism showed no overall association with oncourological risk (P = 0.944). Marked sexual dimorphism was established: in males, the homozygous C/C genotype of ANRIL rs1333049 increased ccRCC risk 3.12-fold (P = 0.05, OR = 3.12; 95% CI: 1.0–9.75); the minor G-allele of MALAT1 rs619586 was associated with ccRCC primarily in men (P = 0.008), whereas in UCB it predominated in women (P = 0.013). Molecular-phenotypic associations revealed that the MALAT1 A/A genotype was linked to greater height and body weight (P < 0.0001) but not BMI; for ANRIL rs1333049, the C-allele exerted a protective effect against UCB in individuals with BMI < 25 kg/m² (P = 0.04, OR = 0.22), which was neutralized at BMI ≥ 25 kg/m²; HOTAIR G-allele carriers demonstrated higher BMI (29.65 vs. 26.72 kg/m², P = 0.042). A phenomenon of genetic effect inversion at ANRIL rs1333049 was identified depending on smoking: in smokers, the C/C genotype was a risk factor for ccRCC (P = 0.040, OR = 3.64), whereas in non-smokers, carrying the C-allele was protective (P = 0.016, OR = 0.17). MALAT1 variability was shown to determine disease aggressiveness: the G-allele was associated with an 11-year earlier manifestation of UCB (65 vs. 76 years, P = 0.032), a 2.74-fold increased risk of metastasis (P = 0.02, OR = 2.74), and significantly reduced overall survival in ccRCC patients (P = 0.0101). Based on these patterns, an algorithm for clinical-genetic stratification of patients was developed to establish personalized monitoring and lifestyle management programs.

Read more

Research papers

Stroi Ye. Sex-specific association of the rs4759314 polymorphism in the HOTAIR gene with urinary system cancer development. Ukrainian Journal of Nephrology and Dialysis. 2025. № 3 (87). Р. 45–52.

Stroi Ye. Analysis of association between MALAT1 gene rs619586-polymorphism and disease-free survival in kidney cancer and bladder cancer patients. Eastern Ukrainian Medical Journal. 2025. Vol. 13. №4. P. 1157–1167.

Stroi Ye., Volkohon A., Obukhova O. Analysis of the association of rs1333049-polymorphic variants of the ANRIL gene with the development of clear cell renal cell carcinoma in Ukrainian population. Wiad Lek. 2025. Vol. 78. №9. Р. 1805–1812.

Stroi Ye., Volkohon A., Moskalenko Yu. Association analysis between MALAT1 rs619581-polymorphism and urinary tract cancer development in Ukrainian population. Eastern Ukrainian Medical Journal. 2025. Vol. 13. №3. Р. 748–756.

Строй Є. А. Дослідження асоціації rs4759314-поліморфізму гена HOTAIR із розвитком метастазів у пацієнтів з онкологічними захворюваннями сечовидільної системи. Буковинський медичний вісник. 2025. Т. 29, № 4 (116). С. 23–28.

Строй Є. А. Пошук зв’язку rs1333049-поліморфного локусу гена ANRIL із розвитком метастазів у пацієнтів із раком сечового міхура і раком нирки. Здобутки клінічної і експериментальної медицини. 2026. № 4 (2025). С. 136–141.

Строй Є. Статеві особливості асоціації rs1333049-поліморфного локусу гена ANRIL із розвитком раку сечового міхура. Актуальні проблеми сучасної медицини. 2025. Том 25. № 4. С. 215–219.

Stroy Ye. A., Moskalenko Yu. V., Obukhova O. A. Allelic variant frequency of the MALAT1 gene by rs619581 polymorphism in patients with transitional cell carcinoma of the bladder. BioGENext: Next Generation Therapy Conference. Biopolymers and Cell. 2024. Vol. 40, No. 3. P. 200.

Строй Є. А. Зв’язок rs4759314-поліморфних варіантів гена HOTAIR із розвитком світлоклітинного раку нирки в осіб різної статі. Патологічна фізіологія – охороні здоров’я України : тези доповідей IX Національного конгресу патофізіологів України за міжнародної участі (19–21 вересня 2024 р.). Івано-Франківськ : Івано-Франківський національний медичний університет, 2024. С. 197–198.

Строй Є. А. Розподіл rs4759314-поліморфних варіантів гена HOTAIR у пацієнтів із раком сечового міхура. Biomedical Perspectives ІV : збірник тез доповідей Міжнародної медичної конференції студентів, аспірантів та молодих вчених (Суми, 24–25 квітня 2024 р.). Суми : СумДУ, 2024. С. 120.

Строй Є. А. Зв’язок rs4759314-поліморфних варіантів гена HOTAIR із розвитком онкологічних захворювань сечовидільної системи. Biomedical Perspectives V : збірник тез доповідей Міжнародної медичної конференції студентів, аспірантів та молодих вчених (Суми, 24–25 квітня 2025 р.). Суми : СумДУ, 2025. С. 31.

Строй Є. А. Зв’язок rs4759314-поліморфних варіантів гена HOTAIR із розвитком метастазів у пацієнтів з онкологічними захворюваннями сечовидільної системи. Механізми розвитку патологічних процесів і хвороб та їх фармакологічна корекція : матеріали VІІ науково-практичної internet-конференції за міжнародної участі (Харків, 20 жовтня 2025 р.). Харків : НФаУ, 2025. С. 234.

Строй Є., Лебедь Л. Асоціація алельних варіантів гена ANRIL за rs1333049-поліморфізмом у пацієнтів із світлоклітинним раком нирки. Майбутнє за наукою : матеріали XХІX Конгресу студентів та молодих учених (Тернопіль, 9–11 квітня 2025 р.). Тернопіль : Укрмедкнига, 2025. С. 127–128.

Read more

Files

Stroi_PhD_thesis.pdf

autoreferat-Stroi_PhD_ref.pdf

Similar theses

0826U005121

Anton Roshchupkin

Biomedical patterns of using MXene for photothermal therapy of malignant tumours

0826U005120

Serhii Nehlushchenko

Traumatic blood loss. Optimization of therapeutic and diagnostic measures at the prehospital and early hospital stages

0826U005090

Volodymyr V. Raikevych

Experimental substantiation of the use of PRP-therapy in the treatment of trophic ulcers

0826U005116

Maryna V. Railian

Optimization of Epidemiological Surveillance and Prevention of Healthcare-Associated Infections in Healthcare Facilities under Emergency Conditions

0826U005019

Liudmyla Konovalenko

Improving the diagnosis and treatment of overlap syndrome (atopic dermatitis and allergic contact dermatitis) taking into account the influence of allergen-specific immunotherapy.