Мороз Б. Л. Синтез та фізико-хімічні властивості функціоналізованих гем-дифторобіциклоалканів та їх азааналогів

English version

Дисертація на здобуття ступеня доктора філософії

Державний реєстраційний номер

0826U004850

Здобувач

Спеціальність

  • 102 - Хімія

03-09-2026

Спеціалізована вчена рада

PhD 16518

Інститут органічної хімії Національної академії наук України

Анотація

Дисертаційна робота присвячена розробці синтетичних підходів до гем-дифторованих насичених біциклічних каркасів (гетеро)аліфатичного ряду та встановленню закономірностей впливу фторованого фрагмента та конформаційних обмежень, притаманних біциклічним системам, на фізико-хімічні параметри, що є релевантними для потреб медичної хімії (кислотно-основні властивості та ліпофільність). Основну увагу було зосереджено на кислотно-основних властивостях і ліпофільності, оскільки саме ці характеристики значною мірою визначають поведінку малих молекул у біологічному середовищі, зокрема їхню розчинність, здатність до мембранного транспорту, розподіл між водною та ліпідною фазами, а також характер взаємодії з біомолекулярними мішенями. Вибір гем-дифторованих біциклічних структур як об’єктів дослідження був зумовлений поєднанням двох важливих факторів: вираженого електроноакцепторного впливу фторованого фрагмента та жорсткої просторової організації біциклічного ядра, яка може істотно модулювати прояв цього ефекту. У ході виконання дослідження розроблено та реалізовано ефективні масштабовані синтетичні підходи до низки діастереомерно чистих функціоналізованих похідних гем-дифторованих біцикло[3.n.0]алканів, зокрема 6,6-дифторобіцикло[3.1.0]гексану, 6,6-дифторобіцикло[3.2.0]гептану та екзо-/ендо-5,5-дифтороктагідропентален-2-амінів, що забезпечують отримання ключових проміжних та цільових сполук у (багато)грамових кількостях. Продемонстрована ефективність протоколу повільного додавання (slow addition) для гем-дифтороциклопропанування неактивованого алкену в системі TMSCF3–NaI у грамових кількостях. Оптимізовано одержання діастереомерно чистих похідних біцикло[3.1.0]гексану через хроматографічне розділення цис-/транс-ізомерів відповідних етилових естерів карбонових кислот на ранній стадії. Отримані ендо- та екзо-ізомери октагідропенталенового ряду через комбінацію діастереоселективного відновлення карбонільної групи та інверсії конфігурації за реакцією Міцунобу та підтверджена їх відносна стереохімія за допомогою експериментів NOE. Виконано систематичне експериментальне дослідження ключових фізико-хімічних параметрів (pKa і LogP) для серій гем-дифторованих біциклічних амінів/кислот та їх нефторованих і/або моноциклічних аналогів. Показано, що зниження pKa при гем-дифторуванні у більшості випадків корелює з кількістю С–С зв’язків між фрагментами N та CF2, що підтверджує домінування індуктивного ефекту. Продемонстровано експериментально, що ефект гем-дифторування на LogP (ΔLogP) є неоднозначним і може змінювати знак залежно від топологічно-залежної відстані між гем-CF2 та амідним фрагментом і/або від локального оточення (зокрема від кількості віцинальних C–H зв’язків). В той же час, середня ліпофільність демонструє виражену залежність від кількості атомів C+N у каркасі. Для пояснення впливу тривимірної будови молекул на фізико-хімічні властивості експериментальні значення ΔLogP співставлялися з кількісним аналізом карт розподілу електростатичного потенціалу (MEPS) для серії фторованих/нефторованих пар, що дозволило встановити закономірності зміни ΔLogP/LogP для підгруп сполук із різною топологією каркаса (зокрема, відмінність поведінки циклопропановмісних систем від інших представників серії). На основі знайдених закономірностей, запропонована та обґрунтована роль гіперкон’югації σ(C–H)-σ*(C–F) як одного з важливих чинників локальної поляризації поверхні молекули та відповідної зміни ліпофільності. Методами молекулярного докінгу та молекулярної динаміки було показано, що конформаційно обмежені аналоги Маравіроку аналоги можуть забезпечувати режим зв’язування, співставний з еталонною молекулою.

Публікації

1. Liashuk O., Moroz B., Melnykov K., Holovach S., Lesyk D., Lesyk Y., Skrypnik D., Holota Yu., Borysko P., Filatov A., Grygorenko O. O. Basicity and Lipophilicity of gem-Difluorinated Saturated Bicyclic Amines: Advanced Building Blocks for Drug Discovery. Eur. J. Org. Chem.. 2025; 000:e202500728.

2. Moroz, B.; Melnykov, K. P.; Holovach, S.; Filatov, A. A.; Raievskyi, O.; Platonov, M.; Liashuk, O.; Volochnyuk, D. M.; Grygorenko, O. O. 6,6-Difluorobicyclo[3.1.0]hexane as a rigidified 4,4-difluorocyclohexane mimetic: multigram synthesis, physicochemical characterization, and incorporation into Maraviroc analogs. J. Fluorine Chem. 2023, 272, 110215.

3. Voloshyna, O.; Moroz, B.; Melnykov, K. P.; Holovach, S.; Lesyk, D.; Holota, Y.; Borysko, P.; Filatov, A. A.; Grygorenko, O. O. Gram-scale synthesis and physicochemical properties of exo- and endo-5,5-difluorooctahydropentalen-2-amines. J. Fluorine Chem. 2025, 287, 110484.

4. Moroz, B. L.; Holovach, S. M.; Melnykov, K. P.; Lesyk, D. S.; Filatov, A. A.; Grygorenko, O. O. Synthesis and physicochemical characteristics of 6,6-difluorobicyclo[3.2.0]heptane derivatives. J. Org. Pharm. Chem. 2024, 22(3), 3–9.

5. Вплив гем-дифлуорування на значення pKa функціоналізованих біциклоалканів / Мороз Б. Л., Ляшук О. С., Мельников К. П., Головач С. М., Філатов А. А., Григоренко О. О. // ХV Всеукраїнська конференція молодих вчених, студентів та аспірантів з актуальних питань хімії, 7–10 жовтня 2025 р. – Харків, 2025. – С. 24.

6. gem-Difluorinated saturated O- and N-heterocycles – physicochemical properties and applications / Oleksandr S. Liashuk, Kostiantyn Melnykov, Serhii Holovach, Valeriia Shatnia, Bohdan Moroz, Serhii Kinakh, Oleksandr Grygorenko. // 30th EUROPEAN CONFERENCE ON HETEROCYCLES IN CHEMISTRY // 24-28 August, 2025 – Budapest, Hungary - PO013, p.60

7. gem-Difluorinated saturated O- and N-heterocycles - the new tools for fine tuning of physicochemical properties / Oleksandr Liashuk, Kostiantyn Melnykov, Serhii Holovach, Valeriia Shatnia, Bohdan Moroz, Serhii Kinakh, Oleksandr Grygorenko // ACS Fall 2025, Washington, DC, USA, 17-21 August 2025.

Файли

Схожі дисертації