Король Н. А. Характеристика структурної області генома помірного бактеріофага ZF40 Pecobacterium carotovorum

Дисертаційна робота присвячена дослідженню організації структурної області генома, вивченню особливостей морфогенетичного розвитку віріонів та ідентифікації основних структурних білків помірного бактеріофага ZF40 P. carotovorum subsp. carotovorum (Рсс). Визначено, що адекватним індикатором для літичного розвитку бактеріофага ZF40 є штам Рсс M2-4/50RI, який дозволяє отримати стабільні фагові частки. Водночас, розмноження вірулентних варіантів фага на культурі Pcc RC5297 призводить до накопичення окремих структурних компонентів віріона. Описано природу структурної гетерогенності фагової популяції, яка лежить в площині порушення ключових стадій морфогенезу і морфопоезу віріона. Ці особливості відображаються на стабільності фагових часток і стійкості їх до дії осмотичного шоку. З використанням альтернативного підходу, розробленого на основі фага Т4 і його амбер-мутанта T4Dam23(Н11), вперше отримано висококонцентровані препарати структурних компонентів фага ZF40 та встановлено їх поліпептидний склад. Методом тандемної мас-спектрометрії вперше проаналізовано білки, що входять до складу віріонів фага ZF40, ідентифіковано його основні структурні білки і визначено гени, що їх кодують: gp46 – основний білок капсида (33,95 кДа), gp52 - основний білок футляра (39,2 кДа) і gp50 – гіпотетичний основний білок стрижня хвостового відростка (18,3 кДа). Визначено, що структурна область генома помірного бактеріофага ZF40 Р. carotovorum subsp. carotovorum має класичну будову, характерну фагам родини Myoviridae, і співвідноситься з даною областю геномів фагів, що належать до групи PLPE-подібних вірусів бактерій. Ключові слова: Рectobacterium carotovorum, помірний бактеріофаг ZF40, геном, морфогенез, гетерогенність популяції, структурна область генома, структурні білки, основний білок капсида, хвостовий відросток фага, хроматографічний аналіз, мас-спектрометрія.