Степанюк С. В. Молекулярно-генетична діагностика пандемічних штамів вірусу грипу А(H5N1) та А(H1N1)

Дисертація присвячена вивченню біологічних та молекулярно-генетичних особливостей пандемічних штамів вірусу грипу: кримського ізоляту пташиного вірусу грипу А (H5N1) та пандемічних штамів вірусу грипу А(H1N1)pdm09 з метою розробки високочутливих тест-систем на основі методу ПЛР в режимі реального часу для діагностики та генотипування даних вірусів. Встановлено, що кримський ізолят вірусу грипу А (H5N1) – LA-NK-21205 належить до групи високопатогенних вірусів пташиного грипу НРА/H5N1. При сиквенуванні гемаглютиніну Н5 кримсього ізоляту вірусу LA-NK-21205 ми виявили множинні вставки аргініну та лізину (RRRKKR в позиції 1050-1065) в сайті розрізання гемаглютиніну на дві молекули (НА1 та НА2). Дана послідовність має 100% гомологію з сайтом розрізання гемаглютиніну Н5 сучасних високопатогенних вірусів пташиного грипу НРА/H5N1. Молекулярно-генетичний аналіз сиквенованих генів кримського ізоляту вірусу грипу А (H5N1) – LA-NK-21205 та порівняння з відповідними нуклеотидними послідовностями сучасних високопатогенних вірусів пташиного грипу НРА/H5N1 виявили висококонсервативні ділянки (гомологія 98-100%) в 3-х генах вірусу (М-ген, H5 та N1) пташиного вірусу грипу. Порівняльний молекулярно-генетичний аналіз штамів пандемічного вірусу грипу А(H1N1)pdm09 виявив спорідненість майже на 95% генів досліджуваних нами каліфорнійських штамів та низьку гомологію (<50%) з сезонними штамами вірусу грипу А(H1N1). Обрані висококонсервативні ділянки вірусів грипу НРА/H5N1 та А(H1N1)pdm09 використовували для розробки вітчизняних діагностичних тест-систем. Розроблені тест-системи «DIA-Real Avian Influenza» для діагностики пташиного вірусу грипу НРА/H5N1 та «DIA Influenza H1N1» для діагностики пандемічних штамів вірусу грипу А(H1N1)pdm09 запатентовані та зареєстровані в Міністерстві АПК України та в МОЗ України (реєст.свід. № 9533/2010 від 01.07.2011).