Галкін О. В. Експресія генів протеаз у клітинах гліоми лінії U87 за умов пригнічення IRE1.

Об’єкт: Молекулярні механізми експресії генів протеаз за умов пригнічення сенсорно-сигнального ензиму стресу ендоплазматичного ретикулума IRE1, а також гіпоксії, дефіциту глюкози або глутаміну в клітинах гліоми лінії U87 в залежності від активності IRE1. Методи: Вестерн-блот аналіз протеїнів, виділення РНК та екстрактів протеїнів з клітин, наноспектрофотометричне визначення кількості РНК та їх спектральних характеристик, синтез комплементарних ДНК за допомогою зворотних транскриптаз, кількісна полімеразна ланцюгова реакція у реальному часі, електрофоретичний аналіз нуклеїнових кислот, культивування клітин та статистичний аналіз отриманих результатів. Робота присвячена вивченню експресії генів протеаз за умов гіпоксії і дефіциту глюкози або глутаміну у клітинах гліоми лінії U87 з пригніченими кіназною та ендорибонуклеазною активностями основного сенсорно-сигнального ензиму стресу ендоплазматичного ретикулума IRE1, а також їх можливої участі у IRE1-залежному рості злоякісних пухлин, зокрема гліом. Було продемонстровано, що за умов пригнічення IRE1 рівень експресії генів USP4, CTSC, CTSK та CTSS – знижується, тоді як для всіх інших досліджених генів протеаз спостерігалося збільшення рівня їх експресії, що вказує на диференційний характер IRE1-залежної регуляції їх експресії. Встановлено, що рівень експресії більшості досліджених генів специфічних до убіквітину пептидаз і катепсинів, а також генів HTRA1 і STC2 є залежними від гіпоксії, дефіциту глутаміну та глюкози і що ця залежність істотно змінювалась за умов пригнічення IRE1. Оскільки виявлені за умов пригнічення IRE1 зміни в експресії генів CTSC, CTSL, CTSS, HTRA1 та SCT2 у клітинах гліоми лінії U87 асоціюються зі зниженням проліферації цих клітин і росту із них пухлин, то вони можуть бути використані для пошуку більш ефективних шляхів пригнічення росту гліом.