Афанасьєва К. С. Організація петельних доменів ДНК при різних функціональних станах клітин

У роботі проаналізовано фізичні механізми міграції ДНК при кометному електрофорезі ізольованих клітин і доведено, що петлі ДНК лізованих клітин відповідають петельним доменам хроматину in vivo. Біоінформатичний аналіз вказує, що результати кометного електрофорезу узгоджуються із даними Ні-С: петлі ДНК розподілені за розміром відповідно до закону експоненційного згасання, параметри якого є клітинно-специфічними. Еухроматинові компартменти ядра характеризуються більшою кількістю петель ДНК, ніж гетерохроматинові. За допомогою розробленого у роботі підходу до аналізу петель ДНК на основі кометного електрофорезу досліджено зміни петельної організації у різних типах клітин за різних функціональних станів. Встановлено, що усі петлі ДНК розділяються на три групи: поверхневі, внутрішні і внутрішні великого розміру (більше 300 тис. пар нуклеотидів). Зміна функціонального стану клітин завжди супроводжується реорганізацією.