Борисюк А. Л. Визначення параметрів кінетичних моделей іонних каналів з макроскопічних синаптичних струмів

English version

Дисертація на здобуття ступеня кандидата наук

Державний реєстраційний номер

0414U004566

Здобувач

Спеціальність

  • 03.00.02 - Біофізика

14-10-2014

Спеціалізована вчена рада

Д 26.198.01

Інститут фізіології ім. Богомольця Національна академія наук України

Анотація

Дисертацію присвячено оцінюванню кінетичних констант, величини струму поодинокого каналу і кількості іонних каналів з набору макроскопічних синаптичних струмів. Для швидкого і точного оцінювання цих параметрів розроблено новий метод, що належить до класу методів максимізації функції правдоподібності. Метод враховує кореляції між частинами макроскопічного струму, зареєстрованими в різні моменти часу, і використовує той факт, що коваріаційна матриця макроскопічних струмів є семісепарабельною, для обчислювально ефективного і точного оцінювання функції правдоподібності набору макроскопічних струмів та її градієнта. Обчислювальна складність методу зростає лінійно з числом станів у моделі іонного каналу, на відміну від кубічної залежності у найбільш ефективного з раніше описаних методів. Розроблений підхід дозволяє оцінювати параметри кінетичних моделей, що мають дуже складну топологію. На противагу іншим методам цього типу, розроблений метод є застосовним до постсинаптичних струмів і дозволяє оцінити кінетичні константи синаптичних рецепторів з експериментально досяжної кількості рєстрацій постсинаптичних струмів. При цьому точність оцінки величини струму поодинокого каналу синаптичного рецептора є кращою за точність методу аналізу нормованих на пік нестаціонарних флуктуацій. Це призводить до можливості оцінити цей важливий параметр з високою точністю лише з декількох постсинаптичних струмів, що можуть бути легко зареєстровані в стаціонарних умовах. Ключові слова: метод максимальної правдоподібності, кінетична модель, семісепарабельна матриця, синаптичний струм, ГАМКА рецептор, струм поодинокого каналу, аналіз нестаціонарних флуктуацій.

Файли

Схожі дисертації