Микуляк В. В. Молекулярна динаміка тирозил-тРНК синтетази еубактерії Mycobacterium tuberculosis та формування метастабільних елементів в активному центрі

Дисертацію присвячено дослідженню молекулярної динаміки тирозил-тРНК синтетази еубактерії Mycobacterium tuberculosis у водно-іонному розчині. Проведено дослідження динаміки ферменту у вільному стані, у комплексах з різними субстратами та інгібіторами. Вперше показано динамічне формування антипаралельних стрендів у неструктурованій каталітичній KMSKS-подібній петлі, яка характерна для аміноацил-тРНК синтетаз класу І. Виявлено, що структури, які динамічно формуються у ході динаміки ферменту, підтримують каталітичну петлю в "закритій" конформації, спрямовуючи каталітичний KMSKS-подібний мотив у активний центр. Проведено дизайн нових інгібіторів ферменту на основі структури відомого інгібітора тирозил-тРНК синтетаз бактерій SB-219383.