Шилін С. О. Філогенетичний аналіз, ідентифікація та рекласифікація метано- і метилотрофних бактерій

Дисертація присвячена ідентифікації метано- і метилотрофних бактерій. За допомогою сиквенс-аналізу гену 16S рРНК було ідентифіковано та рекласифіковано 8 штамів облігатних метанокислюючих і 15 штамів факультативних метилотрофних бактерій, в тому числі 2 штами метилотрофів, виділених з екстремальних умов (Антартика). Вперше встановлено самостійний таксономічний статус штаму УКМ В-3075, та описано вид Methylomonas rubra. На підставі поліфазного аналізу штами термотолерантних метанокислюючих бактерій УКМ В-3026, УКМ В-3032, УКМ В-3109 рекласифіковані як Methylocaldum szegediense, штам УКМ В-3014 - як Methylocaldum gracile; штам мезофільних метанокислюючих бактерій УКМ В-3159 - як Methylobacter marinus. Також вперше підтверджений таксономічний статус штамів УКМ B-3002 і УКМ В-3494 (вид Methylococcus capsulatus). У результаті вивчення комплексу діагностичних ознак вивчені факультативні метилотрофи були віднесені до роду Methylobacterium і ідентифіковані. Штами УКМ В-3383 та УКМ В-3357 віднесені до виду Methylobacterium mesophilicum; УКМ В-3360, УКМ В-3362, УКМ B-3368 і УКМ В-3381 - Methylobacterium extorquens; УКМ В-3389 - Methylobacterium organophilum. Вперше були рекласифіковані штами факультативних метилотрофів: УКМ B-3339 як Methylobacterium zatmanii (раніше - M. organophilum), УКМ B-3342 як Methylobacterium fujisawaense (раніше - M. organophilum), УКМ В-3351 як Methylobacterium fujisawaense (раніше - M. extorquens). За результатами поліфазного аналізу вперше запропоновано об'єднати в один вид Methylobacterium extorquens види факультативних метилотрофів M. extorquens, M. zatmanii, M. rhodesianum; та в один вид Methylobacterium mesophilicum види факультативних метилотрофів M. fujisawaense M. radiotolerans, M. mesophilicum.