Танін В. О. Нові підходи до in silico дослідження інгібіторів протеїнтирозинфосфатази 1B

Протеїнтирозинфосфатаза 1В та синтетичні інгібітори цього ензиму. Розробка нових підходів до in silico дослідження потенційних інгібіторів протеїнтирозинфосфатази 1В, розробка нових методів відбору сполук, які найбільш вірогідно проявлять себе як сильні інгібітори щодо РТР1В. Молекулярний докінг, QSAR, кінетичний і статистичний аналіз. Вперше було проведено порівняння конформацій РТР1В згідно даних PDB-файлів для характеристики ліганд-зв'язувальних центрів та рухливості залишків амінокислот. Центроїди кластерів запропоновано як репрезентативні структури PTP1B для проведення розрахунків методом молекулярного докінгу. Розроблено методологію молекулярного докінгу для вивчення зв'язування лігандів у великих зв'язувальних порожнинах. Побудовано три моделі QSAR для оцінювання активності інгібіторів PTP1B. Розроблено оціночні функції для молекулярного докінгу, що базуються на відомих оціночних функціях програм AutoDock і AutoDock Vina, а також RF Score, які показали вищу ефективність у порівнянні з вихідними функціями. Обґрунтовано застосування нових підходів для пошуку інгібіторів РТР1В. Розроблені методи вже використовують для відбору потенційних інгібіторів для різноманітних ферментів. Сфера використання розробок - біоорганічна хімія.