Лиманська О. Ю. Молекулярні технології в типуванні та детекції патогенів бактеріальної і вірусної природи

Об'єкт дослідження: геномна ДНК мікобактерій туберкульозного комплексу, представників групи Bacillus cereus sensu lato, протеїв, провірусна ДНК вірусів імунодефіциту та лейкозу великої рогатої худоби. Мета дослідження: створення надійних технологій ранньої детекції та генотипування мікобактерій туберкульозного комплексу, протеїв, ретровірусів та інших соціально значущих патогенів і розробка підходів до структурної диференціації геномів патогенів людини і тварин. Методи дослідження: комп'ютерний аналіз, стандартна полімеразна ланцюгова реакція та її модифікації з наступним аналізом поліморфізму довжини рестрикційних фрагментів та секвенуванням амплікона, атомно-силова мікроскопія, УФ-спектроскопія з термічною денатурацією, мас-спектрометрія з матрично-активованою лазерною десорбцією/іонізацією. Pезультати: створено молекулярно-генетичні набори, що дозволяють здійснювати диференціацію близькоспоріднених мікобактерій туберкульозного комплексу, розповсюджених патогенів сечового тракту людини Proteus mirabilis та P. vulgaris, видоспецифічну детекцію бактерій групи Bacillus сereus sensu lato. Розроблено молекулярну технологію визначення однонуклеотидних поліморфізмів, асоційованих з резистентністю мікобактерій туберкульозу до протитуберкульозних препаратів. Новизна: наведено нове вирішення проблеми підвищення ефективності методів молекулярної детекції та типування соціально значущих інфекційних збудників вірусної і бактеріальної природи та пошуку структурно-функціональних маркерів у їхньому геномі. Упровадження: технологія детекції точкових мутацій у геномі патогенів може бути застосована для визначення генетично детермінованої резистентності збудників інфекційних захворювань до лікарських препаратів. Використання: розроблені способи виявлення геномних нуклеїнових кислот значущих патогенів людини і тварин можуть бути застосовані при проведенні епідеміологічних, епізоотичних та діагностичних досліджень в системі закладів охорони здоров'я і ветеринарної медицини.