Забуранний Н. В. Структурна геноміка регуляторних елементів, що задіяні у біосинтезі антибіотиків-інгібіторів бактерійних трансглікозилаз

Виявлено нові регуляторні елементи, що контролюють біосинтез промислово важливих антибіотиків моеноміцинів і тейкопланіну видами S. ghanaensis і A. teichomyceticus, відповідно. Показано, що геном продуцента моеноміцину S. ghanaensis містить увесь набір генів, що кодують ортологи описаних плейотропних регуляторів вторинного метаболізму S. coelicolor. Запропоновано моделі регуляторних мереж, у яких задіяно ці елементи. Доведено активаторну роль гена tcp28 у біосинтезі тейкопланінів. Показано, що біосинтез тейкопланіну штамом A. teichomyceticus контролюється на шлях-специфічному рівні двома генами, що кодують транскрипційні активатори Tcp28 і Tcp29. Дані in silico та in vivo аналізу узгоджуються з припущенням, що Tcp28 ініціює транскрипцію гена tcp29, а продукт останнього активує транскрипцію решти структурних tcp-генів. Проведено маніпуляції з геном tcp28, що дають змогу суттєво підвищити рівень продукції тейкопланіну. Розроблено веб-сервіс для аналізу і візуалізації на геномному рівні відносного внутрішньогенного розташування кодонів.