Чередник Ю. О. Ефективність використання різних геномних маркерів Mycobacterium tuberculosis для удосконалення технології діагностики туберкульозу

Дисертацію присвячено вивченню ефективності діагностичних маркерів (до мішеней katG, Is6110, hsp65, hupB, rpoB, mpt64 і mtp40) та маркерів генотипування (ETR (локуси A, B, C, D, E), SNP katG463 та gyrA95 та LSP делеції TbD1) на клінічних ізолятах M. tuberculosis, що циркулюють у м. Києві серед хворих на ЛТБ. Показано, що загальна ефективність ПЛР-діагностики у зразках мокротиння вища ніж методів мікроскопії та культурального посіву. Доведено, що на етапі ранньої ПЛР-діагностики диференційне виявлення штамів ПГГ-1 та ПГГ-2/3 за допомогою SNP-специфічного маркера katG є інформативним методом виявлення носіїв епідеміологічно-небезпечних штамів ПГГ-1, переважну частину яких у київській популяції клінічних штамів M. tuberculosis складають Beijing-штами. Генотипування M. tuberculosis за допомогою комбінованої стратегії ETR-VNTR та SNP-типування показало підвищення точності і дискримінаційної здатності порівняно із ETR-VNTR окремо. Штами родини ПГГ-1 Beijing та ПГГ-2 LAM є найрозповсюдженішими генетичними варіантами та найбільш епідеміологічно-значущими родинами популяції клінічних штамів M. tuberculosis м. Києва. Їх подальше детальніше генотипування є перспективним для удосконалення стратегії характеристики збудника ТБ у регіоні.