Ширина Т. В. Малі РНК, закодовані в районах геному вірусу ядерного поліедрозу Bombyx mori і Autographa californica

Об'єкт дослідження: дві ділянки геному ДНК ВЯП B. mori і A. californica, що містять надпізні (ph - orf1629) і комплементарні до них гени (p10 - p74). Мета: з'ясування можливість участі малих РНК у регуляції експресії генів ВЯП A. californica і B. mori, а також довести, що ці РНК є необхідним структурним компонентом поліедрів B. mori. Методи: біоінформатичні методи для пошуку генів miRNAs in silico, біохімічні методи для виділення РНК з поліедрів, методи електрофорезу у агарозному і поліакріламідному гелях для аналізу РНК і РНК-протеїнових комплексів (РНП), метод полімеразної ланцюгової реакції для ідентифікації передбачених попередників miRNA у фракції РНК з поліедрів, методи клонування і сиквенування ампліфікованого фрагменту для підтвердження його відповідності послідовності передбачених попередників miRNA. Результати та новизна: Вперше розроблено алгоритм пошуку генів miRNAs шляхом аналізу вторинної структури альтернативних транскриптів. Вперше показано, що самі пізні гени ВЯП A. californica і B. mori кодують miRNAs. Вперше показано, що ген ВЯП B. mori orf1629 кодує дві малих РНК, комплементарні orf ph мРНК поліедріну. Вперше показано, що поліедри ВЯП B. mori включають дві малі РНК, розміри і нуклеотидні послідовності яких співпадають з параметрами малих РНК, передбачених біоінформатично. Вперше показано, що малі РНК утворюють комплекси з N-кінцевим фрагментом поліпептидного ланцюгу поліедріну. Запропонована гіпотетична модель високомолекулярного РНП-комплексу.