Бояршин К. С. Структурно-функціональні основи редагуючої активності проліл-тРНК синтетази з Enterococcus faecalis

Дисертація присвячена механізмам редагування проліл-тРНК синтетазою прокаріотичного типу продуктів помилкового впізнавання аланіну - аланіл-аденілата і аланіл-тРНКПро. Вперше показано тРНК-залежність швидкості гідролізу аланіл-аденилата ПроРС, що зветься претрансферним редагуванням. Встановлено необхідність 2'- і 3'-гідроксильних груп А76 тРНКПро для прискорення гідролізу аланіл-аденілата. Визначено амінокислотні залишки, що забезпечують ефективність гідролізу аланіл-тРНКПро, що зветься посттрансферним редагуванням. Визначено ключову роль 2'-гідроксильної групи А76 аланіл-тРНКПро в її деацилюванні. Співставлення отриманих експериментальних даних з результатами комп'ютерного моделювання дозволило підтвердити квантово-механічну модель субстрат-асистованого каталітичного гідролізу аланіл-тРНКПро. Співставлення каталітичного механізму гідролізу аланіл-тРНКПро ПроРС бактеріального типу з іншими запропонованими механізмами ферментативного каталізу деацилювання аміноацил-тРНК дозволило підкреслити його оригінальність і функціональну важливість внутрішньомолекулярних взаємодій у субстраті.