Савицький О. В. Комп'ютерне моделювання молекулярної динаміки H. sapiens тирозил-тРНК синтетази та її мутантних форм

Дисертацію присвячено дослідженню молекулярної динаміки H. sapiens тирозил-тРНК синтетази (HsTyrRS) та її мутантних форм у водно-іонному оточенні з використанням грід-технологій. Вперше побудована модель структури повнорозмірної HsTyrRS, для якої показано формування асиметричної компактної структури HsTyrRS, в якій цитокіновий ELR-мотив є екранованим в результаті взаємодії з С-модулем. Проведено комп'ютерне моделювання молекулярної динаміки мутантних форм тирозил-тРНК синтетази, пов'язаних з нейропатією Шарко-Марі-Туса, виявлено локальні конформаційні зміни в неструктурованій петлі CP1-вставки згортки Росcмана, які супроводжуються формуванням метастабільних b-структурних елементів. На основі побудованої моделі комплексу HsTyrRS з тРНК(Tyr) та фактором елонгації eEF1A2 запропоновано механізм впливу мутацій Шарко-Марі-Туса на взаємодію з її макромолекулами-партнерами. Висловлено припущення, що виявлені конформаційні ефекти можуть призводити як до зміни конформації активного центру, так і до зміни специфічних взаємодій мутантних форм з фактором елонгації eEF1A або/та тРНК(Tyr).