Рокицький І. В. Біоінформатичні підходи та репортерна система для дослідження особливостей вживання кодонів у геномах стрептоміцетів

У дисертації розглянуто, які оптимальні моделі еволюції характерні для різних груп білків, та питання, що стосуються використання кодонів у геномах стрептоміцетів. Це, в свою чергу, включає вивчення контекстної залежності у вживання кодонів та моделі еволюційного заміщення кодонів. Щодо останнього, запропоновано новий веб-сервіс для візуалізації кодонних заміщень — cTools (http://biotools.online). Також, обчислено точність декодування рідкісного у стрептоміцетів лейцинового кодона ТТА. У ході виконання дисертації також створено ТТА-специфічну кумат-індуцибельну репортерну системи на основі гена β-галактозидази — sco3479 (lacZsc) та наведено приклади використання такої системи для вивчення експресії ТТА-вмісних генів.